沈陽市化工學校醫藥工程系以培養適應現代醫藥行業發展需要的實用型、技術技能型人才為目標。現開設制藥技術、中藥、藥劑（藥品營銷與管理方向）、中草藥種植、營養與保健、食品生物工藝六個專業，其中制藥技術專業是國家級示范校重點建設專業，中藥專業是獲教育部批準建立的首批現代學徒制試點專業，遼寧省中職院校僅此一所。
該系師資力量雄厚，現有教師49人，其中專業教師32人，其中遼寧省職業教育名師1名，沈陽市名師2名，沈陽市骨干教師6名，高級講師24人，雙師型教師29人，執業藥師11人，執業醫師4人、針灸師1人、工程師1人。醫藥工程系打造了一支數量適當、專兼結合、結構合理、具有豐富教學經驗、較強實踐能力，熱愛職業教育事業的教師隊伍。
該系擁有固體制劑實訓室、液體制劑實訓室、中藥提取實訓室等24個實驗實訓室，2個仿真實訓中心和中藥實訓基地，總建筑面積5000m2，設備總值500多萬元。學生在校期間即可獲得藥物制劑工、中藥炮制工和中藥保健調理師等多個職業資格證書。每年為沈陽及周邊醫藥企業輸送300多名從事制藥生產和檢驗、制藥制備使用維護、藥品營銷管理和中藥調劑等崗位工作的合格人才。
一、制藥技術專業
1.培養目標以及就業崗位：本專業主要面向國內大中小型醫藥企業，培養具備良好的政治思想品德、中等職業教育學生必備的文化知識，具有常用劑型的制備能力及較強的協調、溝通與合作能力，能勝任制藥生產、藥品質量分析檢驗等方面工作，具有終身發展能力的技術技能型人才。
2.主要開設課程：藥物制劑技術、制藥設備使用與維護、藥物分析檢測技術、GMP管理、天然藥物化學、微生物檢驗技術、藥用化學基礎、藥事管理與法規等；
適于崗位：
本專業畢業生可在大中小型醫藥企業、醫療機構制劑室從事制藥生產、藥物分析檢驗、制藥生產設備維護保養等的基層工作；在醫藥類經營企業從事營銷儲運等相關工作。
3.就業面向的主要企業：
面向全省制藥企業、醫療衛生企業、藥品營銷企業。主要就業區域為沈陽地區相關企業。
制藥技術專業學生就業主要面向藥廠，如：東北制藥總廠、沈陽第一制藥廠、沈陽中藥廠、沈陽飛龍藥業有限公司、格林制藥、管城制藥等；
部分學生到醫療衛生企業、藥品營銷企業工作：天士力大藥房、東北大藥房、維康藥房、成大方圓藥房、沈陽國大藥房、同仁堂藥房、盛京醫院等。
二、中藥專業
1.培養目標及就業崗位：本專業主要面向國內大中小型中藥經營、生產企業、醫療機構等企事業單位，培養從事中藥調劑、中藥購銷、中藥保管養護及生產等工作的具備良好政治思想品德及中等職業教育學生必備的文化知識，具有中藥調劑、鑒定、炮制等相關知識與技能及較強的協調、溝通與合作能力的高素質勞動者和技能型人才。
2.主要開設課程：中藥學、中藥鑒定學、中藥藥劑學、方劑學、中藥炮制學、藥用植物、中藥商品學、中醫基礎學、藥理學、中藥生產技術、藥事管理與法規、藥品市場營銷學等。
適于崗位：
本專業畢業生可在中藥批發零售企業從事中藥調劑、中藥經營的基層工作；在醫療機構從事中藥調劑、制劑、炮制等業務工作；在中藥制藥企業從事中藥生產工作；可在企業中擔任銷售代表、收銀、中藥檢驗、中藥庫房保管等工作。
3.就業面向企業：
藥廠，如：東北制藥總廠、沈陽第一制藥廠、沈陽中藥廠、沈陽飛龍藥業有限公司、格林制藥等；
醫療衛生企業、藥品營銷企業：天士力大藥房、東北大藥房、維康藥房、成大方圓藥房、沈陽國大藥房、同仁堂藥房、盛京醫院等。
2015年1月，教育部印發了《關于開展現代學徒制試點工作的通知》，決定遴選一批有條件、基礎好的地市、行業、企業和職業院校開展現代學徒制試點工作。我系中藥專業是遼寧省中職范圍唯一的國家教育部試點“現代學徒制”專業，與遼寧天士力大藥房連鎖有限公司開展深度校企合作，共同制定“工學結合、產教一體”的現代學徒制人才培養方案，實現企業學校的雙主體人才培養，“招生、招工一體化，學員學徒雙身份”。
三、藥劑（藥品營銷與管理方向）專業
1.培養目標及就業崗位：培養以藥學、中藥學、藥品管理法，藥品市場營銷學為基礎，具備從事醫藥市場營銷策劃與管理能力的實用型、技能型、管理型人才。
2.主要開設課程：藥劑學、中藥學、 中藥鑒定、藥理學、方劑學、解剖生理學、微生物學、藥物化學、醫藥商品學、藥事管理法規、中醫基礎、會計基礎、藥品管理法、 藥品市場營銷學。
適于崗位：
制藥企業、藥品營銷企業、醫療衛生企業的藥品宣傳、批發、零售，藥品流通、倉儲、養護，藥品的質量檢驗等崗位。
3、就業面向企業：
主要面向沈陽地區藥品營銷企業、醫療衛生企業：天士力大藥房、東北大藥房、維康藥房、成大方圓藥房、沈陽國大藥房、同仁堂藥房、盛京醫院等。
部分面向藥廠，如：東北制藥總廠、沈陽第一制藥廠、沈陽中藥廠、沈陽飛龍藥業有限公司、格林制藥、管城制藥等。
四、中草藥種植專業
1、主要開設課程：中藥學、中藥鑒定學、中藥藥劑學、方劑學、中藥炮制學、藥用植物、藥用植物栽培、病蟲害防治藥事管理與法規、中藥市場營銷學等。
2、培養目標及就業崗位：本專業主要面向國內大中小型中草藥種植基地、中藥經營企業等企事業單位，培養從事中草藥種植，病蟲害防治，中草藥生產加工、保管養護、中草藥購銷等工作的具備良好政治思想品德及中等職業教育學生必備的文化知識，具有中草藥栽培、中草藥加工、中藥鑒定等相關知識與技能及較強的協調、溝通與合作能力的高素質勞動者和技能型人才。
適于崗位：
本專業畢業生可在中草藥生產種植基地從事中草藥生產加工、中草藥栽培采收、中草藥庫房管理等基層工作；在中藥批發零售企業從事中藥調劑、中藥經營的基層工作；在醫療機構從事中藥調劑、制劑、炮制等業務工作；可在企業中擔任銷售代表、中草藥檢驗等工作。
3、就業面向企業：
藥廠，如：東北制藥總廠、沈陽第一制藥廠、沈陽中藥廠、沈陽飛龍藥業有限公司、格林制藥等；
醫療衛生企業、藥品營銷企業：天士力大藥房、東北大藥房、維康藥房、成大方圓藥房、沈陽國大藥房、同仁堂藥房、盛京醫院等。
五、營養與保健專業
1、主要開設課程：公共營養、基礎營養與食品安全、正常人體結構與功能、臨床診斷與疾病概要、臨床營養、健康管理、中醫食療藥膳等。
2、培養目標及就業崗位：本專業堅持立德樹人，主要面向醫院、學校、幼兒園、養老機構、社區衛生保健機構以及餐飲、食品與保健品行業等行業，培養具有營養保健知識和銷售技能、具有進行營養互補和營養平衡能力、營養食譜制定等技能的德智體美全面發展的高素質勞動者和專業人才。
適于崗位：
本專業畢業生主要面向學校、幼兒園、老人院、社區衛生保健機構以及餐飲、食品與保健品行業等，從事營養評價、營養指導、膳食配制以及相關管理、咨詢、宣教等營養與保健工作。
3、就業面向企業：
學校、幼兒園、老人院、社區衛生保健機構以及餐飲、食品與保健品行業
藥廠，如：東北制藥總廠、沈陽第一制藥廠、沈陽中藥廠、沈陽飛龍藥業有限公司、格林制藥、管城制藥等；
醫療衛生企業、藥品營銷企業：天士力大藥房、東北大藥房、維康藥房、成大方圓藥房、沈陽國大藥房、同仁堂藥房、盛京醫院等。
六、食品生物工藝專業：
1.主要課程：化學基礎、微生物學基礎、食品工程原理、生物工藝學、食品生物技術、釀酒工藝、釀造食品工藝、酶制劑、食品檢驗技術、化學分析技能鑒定、微生物培菌工技能鑒定、釀造工技能鑒定、食品檢驗工技能鑒定、綜合實訓、課程設計、畢業設計等。學生在校期間，可通過技能考核，取得中級食品檢驗工職業資格證書。
2.培養目標及就業崗位：該專業旨在培養能從事食品生物領域生產與技術管理工作的中級應用性技術人才，畢業生應具備食品理化檢測和微生物檢測的基本能力，熟悉食品安全與標準的基本內容，了解食品企業衛生控制技術和質量管理常用工具和方法。
3.就業方向：大中型食品企業、農產品加工業、保健品行業、食品檢驗相關機構，從事食品原輔材料、半成品、成品的檢驗及衛生檢驗崗位工作。
