南昌大學江西醫學院(醫學部)的前身是創辦于1921年的江西公立醫學專門學校。1952年改名為江西省醫學院，1953年更名為江西醫學院。1958 年，與中國人民解放軍第八軍醫學校合并，仍稱江西醫學院。1969年，與江西中醫學院合并，成立江西醫科大學。
1972年11月與江西中醫學院分設，復名為江西醫學院。2005年8月，與南昌大學合并，冠名為南昌大學醫學院。2014年，南昌大學全面實施醫學教育管理體制改革，學院對內冠名為南昌大學醫學部，對外冠名為南昌大學江西醫學院。
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2011-2013年，醫學部獲批科研項目1650項，合同經費2.06億元;2014年，南昌大學獲批國家自然科學基金項目208項(全國高校排名第28位)，其中南昌大學江西醫學院占100項。涌現出了一批有顯示度的科研成果，科技獎勵數量和質量顯著提升。
未來幾年，南昌大學江西醫學院(醫學部)將以改革創新為動力，以提升質量為核心，以人才培養為根本使命，以教育教學、科學研究及社會服務為中心任務，大力推進內涵建設，全面提升辦學實力，為使醫學部建設成為“特色鮮明、國內一流的醫學教育基地”打下堅實的基礎。
