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內蒙古自治區基因診斷研究所、應用解剖研究所、消化病研究所、高血壓病研究所和內蒙古全科醫學培訓中心、內蒙古學校衛生人員培養基地等研究培訓機構設在我校。
學校有非直屬附屬醫院13所、臨床教學實習醫院32所、自治區全科醫學教育培訓基地15個、公共衛生教學基地39個、藥學專業教學基地12個、法醫學專業教學基地13個。
包頭醫學院積極開展國內外交流與合作。與北京大學醫學部、首都醫科大學、山東大學醫學院、西安交通大學醫學院等國內多所知名院校建立密切合作關系;與澳大利亞拉籌伯大學合作辦學，與英國設菲爾德大學、韓國極東大學、英國北方總院、巴恩思利醫院、設菲爾德大學兒童醫院建立友好協作醫院，聘請部分國內外知名人士為名譽教授。
包頭醫學院秉承“團結、敬業、求實、創新”的校訓，弘揚“艱苦奮斗、自強不息、勤儉奉獻”的精神，努力建設成為在國內有一定影響、在少數民族邊疆地區同類院校中處于先進水平、辦學特色鮮明的醫學院校。
